包合法，又稱包接配位法、分子包埋法，該法是利用β-環糊精中空且內部疏水外部親水的結構特點，將疏水性芯材通過形成包結絡合物而形成分子水平上的微膠囊。

環糊精對風味物質具有很好的保護作用，它能有效的防止熱和蒸氣的破壞。β-環糊精是含有7個葡萄糖基毗喃環的冠狀分子，環糊精的內部呈親油性，外部呈親水性，象一個空的分子微膠囊，環糊精可以捕集具有合適的形狀和極性的客體分子。當復合物處于干燥狀態時，客體分子可以被很好的保護起來，避免光、熱和氧氣的破壞。在與水接觸時膠囊化的分子可以從分子包埋體系中釋放出來。

該法形成的微膠囊具有吸濕低，可以長期保存，包覆均勻、結合牢固的優點。

缺點為該法載量低，一般為9-14%，對一些分子來說，β-環糊精相當于”人工酶“，加速了酯的水解反應，造成風味的改變對于水溶性風味物質，產率更低，該法要求芯材分子大小要適應疏水中心的空間位置，而且必須是極性分子，這就大大限制了該法的應用。包合法目前主要應用于香精、色素及維生素等微膠囊化。